La Dirección de Cooperación Nacional e Internacional es el nexo importante para el desarrollo de la cooperación académica, científica y técnica en los ámbitos nacional e internacional.
Ha venido fortaleciendo su programa de cooperación e intercambio académico nacional e internacional, en estrecha colaboración con los responsables de intercambio académico de universidades afiliadas, mediante una estrategia que incluye la negociación de acuerdos internacionales a través de la firma de convenios, para facilitar e impulsar la cooperación científica, el intercambio académico y la movilidad; la pertenencia a redes con Universidades nacionales e Internacionales de Latinoamérica, facilitar el reconocimiento de estudios, títulos y grado, para facilitar la realización de estudios de posgrado, la difusión de la oferta de oportunidades de colaboración nacional y en el extranjero y de la oferta extranjera entre las instituciones afiliadas, la realización de reuniones, congresos, webinars y foros para la discusión y análisis del intercambio académico y la cooperación, la impartición de cursos y conferencias sobre la materia para fortalecer las capacidades institucionales de planeación y gestión de la cooperación.